Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SarnpQ9D1J3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SarnpQ9D1J3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms