Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc167Q9D162 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc167Q9D162 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms