Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa9Q9CZN4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa9Q9CZN4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms