Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdhd3Q9CYW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms