Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl11Q9CXW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms