Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CXL3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CXL3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms