Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgo1Q9CXH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sgo1Q9CXH7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgo1Q9CXH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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