Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed5Q9CXE7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms