Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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