Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tdrd12Q9CWU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd12Q9CWU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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