Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BccipQ9CWI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms