Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhfpl3Q9CTN8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhfpl3Q9CTN8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms