Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msmo1Q9CRA4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msmo1Q9CRA4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms