Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ska2Q9CR46 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms