Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl28Q9CR40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl28Q9CR40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl28Q9CR40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms