Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc43Q9CR29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc43Q9CR29 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms