Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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