Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl49Q9CQ40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl49Q9CQ40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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