Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf8Q99PV0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms