Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cep41Q99NF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms