Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cadm3Q99N28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms