Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b4Q99ME6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b4Q99ME6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms