Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins4Q99LZ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.8 ms