Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp1b1Q99LU0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms