Protein–RNA interactions for Protein: Q99LQ4

Svbp, Small vasohibin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvbpQ99LQ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvbpQ99LQ4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SvbpQ99LQ4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms