Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds2Q99L43 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds2Q99L43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms