Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW9

Itfg1, T-cell immunomodulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itfg1Q99KW9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itfg1Q99KW9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itfg1Q99KW9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms