Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q99KU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q99KU6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q99KU6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q99KU6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q99KU6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q99KU6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Q99KU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q99KU6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q99KU6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q99KU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q99KU6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q99KU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q99KU6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q99KU6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q99KU6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Q99KU6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q99KU6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q99KU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms