Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmp1Q99KU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms