Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps4Q99KG7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps4Q99KG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms