Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pls3Q99K51 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pls3Q99K51 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pls3Q99K51 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms