Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfxn1Q99JR1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfxn1Q99JR1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms