Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd6Q99JI4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd6Q99JI4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms