Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip2Q99JG7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnip2Q99JG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms