Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pacsin3Q99JB8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pacsin3Q99JB8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms