Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SptssbQ925E8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms