Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb6Q922F4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb6Q922F4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms