Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med28Q920D3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms