Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab4bQ91ZR1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms