Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atl3Q91YH5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl3Q91YH5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl3Q91YH5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms