Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA1

Tipin, TIMELESS-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TipinQ91WA1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TipinQ91WA1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TipinQ91WA1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms