Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacng5Q8VHW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacng5Q8VHW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms