Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc115Q8VE99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc115Q8VE99 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms