Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sft2d2Q8VD57 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms