Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BbxQ8VBW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BbxQ8VBW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms