Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ApobrQ8VBT6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms