Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp3Q8R4B8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms