Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc58Q8R3Q6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms