Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk8Q8R3L8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk8Q8R3L8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms