Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sumf1Q8R0F3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sumf1Q8R0F3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sumf1Q8R0F3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms